温州医科大学基因组医学研究院孙中生（院长）课题组2016考研调剂信息

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温州医科大学基因组医学研究院孙中生教授（院长）课题组基于国家发展战略和十三五规划（“脑科学与类脑研究”，“加速推进基因组学等生物技术大规模应用”），主要利用基因组学、生物信息学、医学遗传学、表观遗传学、分子生物学等研究手段从事复杂疾病、特别是神经精神类疾病（例如，孤独症、智力低下）和癌症的遗传学机制研究。本课题组经费充足，已经申请到多个国家级课题，具有各种生物学实验平台、生物信息学分析平台、具有良好的发展前景。科学研究上，本课题组在导师和学生的共同努力下，取得了多项突破性成功：

1、首次发现并报道节律基因PER1和PER2；

2、开发二代测序可视化工具MagicViewer和SplicingViewer，普通电脑可完成大数据可视化；

3、开发MicroRNA在线分析工具，被评为业内最准确的工具之一；

4、通过全外显子测序鉴定到中国第一个孤独症致病基因ANK3；

5、通过高通量测序鉴定肌萎缩侧索硬化症致病基因SOD1；

6、开发了第一款全面的在线的甲基化分析软件RRBS-Analyser；

7、开发了癫痫相关突变与基因数据库EpilepsyGene；

8、开发了第一款在线分析新生突变的工具mirTrios；

9、基于新生突变，首先系统分析神经精神疾病的共有基因和通路，并开发NPdenovo数据库；

10、开发低起始量，单精度的DNA甲基化图谱的实验与分析方法MBRidge；

11、开发单细胞DNA甲基化图谱的实验与分析方法Q-RRBS；

12、开发第一款RNA结合蛋白调控数据库RBP-Var；

13、首次使用全基因组测序分析中国自闭症患者突变图谱；

14、首次鉴定到多个自闭症新基因并进行了深入的分子机制研究；

本课题组在Cell, Molecular Psychiatry, PNAS, Nucleic Acids Research, Journal of Molecular Cell Biology, Genetics in Medicine等国际权威杂志。目前本课题组还有多个基因组学，分子生物学、神经科学的文章Science、Nature Genetics、Nature Neuroscience、Molecular Psychiatry、Annals of Neurology等杂志审稿。

调剂名额：

生物信息学、基因组学等方向2-3名，遗传学、分子生物学等方向1-2名，共计4-5名。

如有意向且符合条件者，请将简历发送至邮件tianguolangzi@yahoo.com， 我们会根据实际情况回复调剂生。联系方式：张坤 18257737467

导师介绍：

孙中生教授简介如下：

博士，研究员，博士生导师，中国遗传学会表观遗传专业委员会主任, Hormones and Behavior杂志编委。1982年北京大学学士；1992年美国德克萨斯A&M大学博士；1993-1998年先后在德克萨斯大学安德生癌症研究中心放射治疗系、贝勒医学院分子人类遗传学系做博士后；1998-1999年任路易斯安那州立大学神经科学中心助理教授、主任助理，同时任生物化学和遗传系助理教授；1999-2005年在美国康奈尔大学任助理教授，威尔医学院特护医学实验室主任；2005-2010年在中国科学院心理研究所行为遗传学中心任研究员，2010年至今任北京生科院研究员。1997年,荣获Science杂志十大科学突破，2006年入选中科院“百人计划”，并入选“新世纪百千万人才工程”。
   http://sourcedb.biols.cas.cn/cn/rck/yjdw/201309/t20130922_3936098.html    

学生待遇：

1、每月发放不低于1300元的生活补贴；

2、所有在读研究生均享受8000－10000元/年的助学金，可抵消全部学费；

3、研究生期间，学生均有自己独立负责的课题，同时参与、合作课题组其他相关课题；

应聘要求：

1.本次招生重点面对生物信息学、基因组学、遗传学、分子生物学等专业；

2.同时欢迎有医学、计算机、数学背景的毕业生；

3.良好的英语阅读写作及听说交流能力；

4.吃苦耐劳，有探索精神，对生命科学研究有浓厚兴趣；

5.有计算机操作、编程基础者或者相关生物实验经验者优先；

6.硕士毕业后有意向继续深造者优先；

7.符合温州医科大学硕士研究生招生调剂条件：http://yjsy.wmu.edu.cn/

培养方案：

不用担心基础，只要你不荒废时间，师兄师姐带你进步。前半年可能在温州修完所有课程，后面所有学生都有机会到北京中科院学习和工作，进行联合培养。我们对入学的同学进行集中培训，包括入门和进阶。在培训方面，我们积累到足够多的经验。等打好基础后，我们根据喜好分配你擅长的任务和课题。天道酬勤，有付出才有收获。

三年结束后，大致两条路。

1、 继续读博：

a)、 优秀硕士生可直接进入中科院攻读博士学位（导师在中科院也招生）；

b)、 优秀硕士毕业生可推荐进入中南大学、东南大学等其他国内一流大学攻读博士学位；

2、 工作：

我们会让你在硕士期间得到充分的锻炼，将生物信息学技术运用到炉火纯青的地步，包括但不限于精通shell，R处理数据及作图，Python和perl分析处理大数据，PHP建站，MySQL建立数据库，PS等。生物信息工程师目前的薪资，可以自己查。我们实验室出去的学生的月薪一万起步。

学术成果：

2016年：

Weiping Tian, Jiesi Wang, Ke Zhang, Huajing Teng, Chong Li, Moshe Szyf, Zhong Sheng Sun & Mei Zhao. Demethylation of c-MYB binding site mediates upregulation of Bdnf IV in cocaine-conditioned place preference OPEN. Scientific Reports, 2016. (IF=5.578)

2015年：

Li JC, Cai T, Jiang Y, Chen HQ, He X, Chen C, Li XF, Shao QZ, Ran X, Li ZS, Xia K, Liu CY, Sun ZS, Wu JY. Genes with de novo mutations are shared by four neuropsychiatric disorders discovered from NPdenovo database. Molecular Psychiatry, 2015. (IF=15.147)

Wanshi Cai , Fengbiao Mao , Huajing Teng, Tao Cai, Fangqing Zhao, Jinyu Wu and Zhong Sheng Sun. MBRidge An accurate and cost-effective method for profiling DNA methylome at single-base resolution. Journal of Moleucular Cell Biology, 2015. (IF=6.771)

Fengbiao Mao, Luoyuan Xiao, Xianfeng Li, Jialong Liang, Huajing Teng, Wanshi Cai, and Zhong Sheng Sun. RBP-Var: a database of functional variants involved in regulation mediated by RNA-binding proteins. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2015. (IF=9.112)

Kangli Wanga, Xianfeng Libc, Shanshan Donga, Jialong Liangbd, Fengbiao Maobd, Cheng Zengb, Honghu Wua, Jinyu Wuab, Wanshi Caib & Zhong Sheng Sunab. Q-RRBS A quantitative reduced representation bisulfite sequencing method for single-cell methylome analyses. Epigenetics, 2015. (IF=4.780)

2014年：

Yan Wang, Guiling Li, Fengbiao Mao, Xianfeng Li, Qi Liu, Lin Chen, Lu Lv, Xin Wang, Jinyu Wu, Wei Dai, Guan Wang, Enfeng Zhao, Kai-Fu Tang and Zhong Sheng Sun. Ras-induced Epigenetic Inactivation of the RRAD Ras-related Associated with Diabetes Gene Promotes Glucose Uptake in a Human Ovarian Cancer Model. JURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2014. (IF=4.573)

Qing Xie , Qi Liu , Fengbiao Mao, Wanshi Cai, Honghu Wu, Mingcong You, Zhen Wang, Bingyu Chen, Zhong Sheng Sun , Jinyu Wu . A Bayesian Framework to Identify Methylcytosines from High-Throughput Bisulfite Sequencing Data. PLOS Computational Biology, 2014. (IF=4.620)

Xia Ran, Jinchen Li, Qianzhi Shao, Huiqian Chen, Zhongdong Lin, Zhong Sheng Sun and Jinyu Wu. EpilepsyGene: a genetic resource for genes and mutations related to epilepsy. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014. (IF=9.112)

2013年：

Jinyu Wu, Qi Liu, Xin Wang, Jiayong Zheng, Tao Wang, Mingcong You, Zhong Sheng Sun &Qinghua Shi. mirTools 2.0 for non-coding RNA discovery profiling and functional annotation based on high-throughput sequencing. RNA Biology, 2013. (IF=4.974)

Tao Wang, Qi Liu, Xianfeng Li, Xiaobing Wang, Jinchen Li, Xiaochun Zhu, Zhong Sheng Sun, Jinyu Wu. RRBS-Analyser A Comprehensive Web Server for Reduced Representation Bisulfite Sequencing Data Analysis. HUMAN MUTATION, 2013. (IF=5.144)

Zhanjun Wang, Wanshi Cai, Fang Cui, Tao Cai, Zhaohui Chen, Fengbiao Mao, Huajing Teng, Lin Chen, Jiesi Wang, Zhongsheng Sun, Xusheng Huang, Ping Yu. Identification of a novel missense C7W mutation of SOD1 in a large familial amyotrophic lateral sclerosis pedigree. NEUROBIOLOGY OF AGING, 2013. (IF=5.013)

Yongqing Wang1, Yan Wang1, Qi Liu, Gang Xu, Fengbiao Mao, Tingting Qin, Huajing Teng, Wanshi Cai, Ping Yu, Tao Cai, Mei Zhao, Zhong Sheng Sun, Congying Xie. Comparative RNA-Seq analysis reveals potential mechanisms mediating the conversion to androgen independence in an LNCaP progression cell model. CANCER LETTERS, 2013. (IF=5.621)

2012年：

Cheng Bi, Jinyu Wu, Tao Jiang, Qi Liu, Wanshi Cai, Ping Yu, Tao Cai, Mei Zhao, Yong-hui Jiang, and Zhong Sheng Sun.Mutations of ANK3 identified by exome sequencing are associated with Autism susceptibility. HUMAN MUTATION, 2012. (IF=5.144)
                                   
Jinyu Wu, Enjian Shen, Dashuang Shi, ZhongSheng Sun & Tao Cai. Identification of a novel Cys146X mutation of SOD1 in familial amyotrophic lateral sclerosis by whole-exome sequencing. GENETICS IN MEDICINE 2012. (IF=7.329)

2011年：

Jianmin Wu1, Gang Wu, Lu Lv, Yong-Feng Ren, Xue-Jiao Zhang, Yong-Feng Xue, Guiling Li, Xincheng Lu, ZhongSheng Sun and Kai-Fu Tang. MicroRNA-34a inhibits migration and invasion of colon cancer cells via targeting to Fra-1. CARCINOGENESIS, 2011. (IF=5.334)

2010年：

Huabin Hou, Fangqing Zhao, LingLin Zhou, Erle Zhu, Huajing Teng, Xiaokun Li, Qiyu Bao, Jinyu Wu and Zhongsheng Sun. MagicViewer Integrated solution for next-generation sequencing data visualization and genetic variation detection and annotation. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2010. (IF=9.112)

Erle Zhu, Fangqing Zhao, Gang Xu, Huabin Hou, LingLin Zhou, Xiaokun Li, Zhongsheng Sun and Jinyu Wu. MirTools MicroRNA profiling and discovery based on high-throughput sequencing. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2010. (IF=9.112)

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温州医科大学 基因组医学研究院

2016年 3 月 9 日

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