华中农业大学

基本信息
姓名:刘智捷
出生年月:1984.12
性别:男
硕/博导：
民族:汉
开设课程：普通遗传学；普通遗传学实验
职称:讲师
研究方向：玉米抗逆分子生物学
学位:理学博士

联系方式办公电话：18207192678
电子邮件：zhijie5.liu@gmail.com

个人简介1.硕士期间参与了“逆境条件下玉米苗期根系miRNA的表达与调控机理研究”，利用小RNA芯片技术鉴定高盐胁迫和低氧胁迫下诱导表达的miRNA，从中建立了miRNA与淹水、高盐逆境的关系，并进一步对miRNA参与的逆境响应通路进行了推测和分析。相关研究成果分别在2008年[5]和2009年[6]均发表于AnnalsofBotany杂志上。
2.2008年以硕博连读的培养方式转入到博士期间的学习，并经郑用琏教授推荐到美国冷泉港DoreenWare教授实验室交流学习三年，期间主要进一步深入探讨miRNA对渍水逆境的响应及其调控途径。通过高通量测序技术对miRNA的表达量进行了深入的定量分析；利用qPCR对miRNA以及其下游靶基因的表达进行了进一步的确认；分析了miRNA基因启动子区的顺式作用元件，构建了miRNA介导的、玉米根系细胞响应短期渍害胁迫的基因表达调控网络，阐述了miRNA在短期渍害逆境条件下参与的代谢及信号通路，并提出了miRNA介导的玉米根系细胞响应渍害的“节能假说”。相关研究成果以第一作者发表在PLoSOne杂志上[4]。
3.在冷泉港的三年期间，也参与了其他课题的研究工作：
1）参与了玉米基因组测序计划，构建了部分测序文库，为玉米B73全基因组测序提供了实验材料和分析数据。相关工作于2009年作为封页文章发表于Science杂志上[1]。
2）构建了5个玉米不同组织的小RNA文库，用于高通量测序。学习并参与了后期的数据分析。研究结果于2009年发表于PLoSGenetics杂志上[3]。
3）参与了拟南芥转录因子文库的构建工作中，共构建了由712转录因子所构成的转录因子文库。利用这一文库筛选了玉米以及拟南芥miRNA的启动子，构建了miRNA的调控网络。部分结果于2011年发表于NatureMethod杂志上[2]。
4.开展了玉米冠根中miRNA对长期淹水逆境胁迫响应的机理研究，参与了数据分析及论文的撰写、修改。研究结果进一步证实了所提出的miRNA介导的渍害响应“节能假说”，并以并列第一作者身份于2012年发表于PhysiologiaPlantarum杂志上[7]。

科研项目

发明专利及获奖情况

发表的论文及著作第一作者发表：
1.LiuZ,KumariS,ZhangL,ZhengY*,WareD*.CharacterizationofmiRNAsinresponsetoshort-termwaterlogginginthreeinbredlinesofZeamays.PLoSOne,2012;7(6):e39786.Epub2012Jun29.
2.ZhaiL,LiuZ,ZouX,JiangY,QiuF,ZhengY,ZhangZ*:Genome-wideIdentificationandAnalysisofMicroRNARespondingtoLong-TermwaterlogginginCrownRootsofMaizeSeedlings.PhysiologiaPlantarum,2012.doi:10.1111/j.1399-3054.2012.01653.x.（并列第一作者）

合作作者发表：
1.SchnablePS,WareD,FultonRS,SteinJC,WeiF,PasternakS,LiangC,ZhangJ,FultonL,GravesTA,MinxP,ReilyAD,CourtneyL,KruchowskiSS,TomlinsonC,StrongC,DelehauntyK,FronickC,CourtneyB,RockSM,BelterE,DuF,KimK,AbbottRM,CottonM,LevyA,MarchettoP,OchoaK,JacksonSM,GillamB,ChenW,YanL,HigginbothamJ,CardenasM,WaligorskiJ,ApplebaumE,PhelpsL,FalconeJ,KanchiK,ThaneT,ScimoneA,ThaneN,HenkeJ,WangT,RuppertJ,ShahN,RotterK,HodgesJ,IngenthronE,CordesM,KohlbergS,SgroJ,DelgadoB,MeadK,ChinwallaA,LeonardS,CrouseK,ColluraK,KudrnaD,CurrieJ,HeR,AngelovaA,RajasekarS,MuellerT,LomeliR,ScaraG,KoA,DelaneyK,WissotskiM,LopezG,CamposD,BraidottiM,AshleyE,GolserW,KimH,LeeS,LinJ,DujmicZ,KimW,TalagJ,ZuccoloA,FanC,SebastianA,KramerM,SpiegelL,NascimentoL,ZutavernT,MillerB,AmbroiseC,MullerS,SpoonerW,NarechaniaA,RenL,WeiS,KumariS,FagaB,LevyMJ,McMahanL,VanBurenP,VaughnMW,YingK,YehCT,EmrichSJ,JiaY,KalyanaramanA,HsiaAP,BarbazukWB,BaucomRS,BrutnellTP,CarpitaNC,ChaparroC,ChiaJM,DeragonJM,EstillJC,FuY,JeddelohJA,HanY,LeeH,LiP,LischDR,LiuS,LiuZ,NagelDH,McCannMC,SanMiguelP,MyersAM,NettletonD,NguyenJ,PenningBW,PonnalaL,SchneiderKL,SchwartzDC,SharmaA,SoderlundC,SpringerNM,SunQ,WangH,WatermanM,WestermanR,WolfgruberTK,YangL,YuY,ZhangL,ZhouS,ZhuQ,BennetzenJL,DaweRK,JiangJ,JiangN,PrestingGG,WesslerSR,AluruS,MartienssenRA,CliftonSW,McCombieWR,WingRA,WilsonRK*:TheB73maizegenome:complexity,diversity,anddynamics.Science326(5956):1112-1115,2009.
2.GaudinierA,ZhangL,Reece-HoyesJS,Taylor-TeeplesM,PuL,LiuZ,BretonG,Pruneda-PazJL,KimD,KaySA,WalhoutAJM,WareD,BradySM.EnhancedY1HassaysforArabidopsis.Naturemethods,2011.8:1053-1055.
3.ZhangL,ChiaJM,KumariS,SteinJC,LiuZ,NarechaniaA,MaherCA,GuillK,McMullenMD,WareD*:Agenome-widecharacterizationofmicroRNAgenesinmaize.PLoSGenet5(11):e1000716,2009.
4.ZhangZ,WeiL,ZouX,TaoY,LiuZ,ZhengY*:Submergence-responsiveMicroRNAsarepotentiallyinvolvedintheregulationofmorphologicalandmetabolicadaptationsinmaizerootcells.AnnBot102(4):509-519,2008.被引用次数：37.IF(2008):3.501
5.DingD,ZhangL,WangH,LiuZ,ZhangZ,ZhengY*:DifferentialexpressionofmiRNAsinresponsetosaltstressinmaizeroots.AnnBot103(1):29-38,2009.